Enzimler ilk olarak genelde diğer molekülleri manipüle eden protein yüklü olan molekülleridir. Asıl hedef moleküller enzimin aktif içinde bölgesine bağlanır ve aynı zamanda enzim mekanizması olarak bilinen bir seri olarak adımlar sonucunda, ürünlere benzerler. Aslında bu mekanizmalar tekli olanlara tek substratlı ve çoklu halde bulunanlara çok substratlı mekanizmalar gibi iki farklı gruba ayrılır. Tek olarak bir substrata bağlanmış olan enzimler kendi üzerinde yapılan kinetik doğrusal yapıda çalışmalar, enzimin asıl substratına bağlanma ilgisini ve devir yapma hızını ölçmeyi hedefler. Farklı olarak bu enzimler birden çok fazla substrata bağlanınca, redüktaz gibi enzim kinetiği olarak bu substratların normal yolla bağlanma sırasını ve ürünlerin salınma ile kendi sırasını net olarak gösterebilir. Başka bir yolla tek bir enzim ile substrata bağlanıp birden fazla ürün salan bu farklı enzimlere en iyi örnek, proteazlardır ve bunlar içinde bulunan bir protein substratını kesip iki polipeptit gibi farklı ürün değişimi oluştururlar. Başka bir diğer enzimler iki substratı ile birleştirir ve buna örnek olarak DNA polimerazın normal olan DNA'ya farklı bir nükleotit ilave etmesi durumu ele alınır. Genel olarak bu mekanizmalar karmaşık olarak bir adımlar düzeneği olsa da aslında tipik olarak bir hız düzenleyen basamak ve tüm reaksiyonun normal düzeydeki hızını belirleyen yöntem olarak bilinir. Bu normal hız belirleyici olan basamak kimyasal bir reaksiyon ile veya enzim substratlarında oldukça farklı bir konformasyonel değişim olabileceği gibi, ürünlerin enzimden salınması döneminde ortaya çıktığı bilinmektedir.

Enzim kinetiği, Normal bir enzimin asıl olarak yapısının bilinmesi ve kinetik verilerin canlı yorumlanmasında oldukça faydalıdır. Buna örnek verilecek olursa, yapının bilinmesi sayesinde bulunan substrat ve ürünlerin normal yolla kataliz sırasında farklı olarak nasıl bağlandıkları, reaksiyon yaparken bu sırada hangi değişikliklerin meydana geldiği ve hatta mekanizmadaki belli amino asit ile kalıntılarınını ve rollerini aslında kolaylıkla tahmin etmek gerekir. Bazı enzimler ilk olarak mekanizma sırasında önemli olarak farklı derecede biçimlerini değiştirirler. Böylesi durumlarda asıl olarak enzimin tek başına yapısının ve enzimatik bir reaksiyona girmeyen substrat analogları ile ona bağlı ikenki normal yapısının belirlenmesi oldukça yararlı olur. Genel olarak tüm biyolojik olan katalizörler protein değillerdir ve ribozom gibi farklı yolla RNA temelli olarak katalizörler pek çok hücresel yolla farklı işlev için esastırlar. Buna örnek olarak, RNA uçbirleştirmesi ve çeviri işaret olarak gösterilir. Ribozimler ve enzimler arasındaki en temel fark, RNA içindeki katalizörlerin nükleotitlerden, enzimlerin ise amino asitlerden meydana geliyor olmasıdır. Ribozimler oldukça daha sınırlı bir reaksiyonlar ile grubunu katalizler, ama normal reaksiyon mekanizmaları ve kinetikleri ile protein enzimleri aynı yollarla analiz edilebilir ve farklı olarak gruplandırılabilirler.

0 Yorum Yapılmış "Enzim Kinetiği"
Kayıtlı yorum bulunamadı ilk yorumu siz ekleyin